1.主持国家自然科学基金面上项目，32371366，2024/01-2027/12。
2.主持国家自然科学基金面上项目，32071256，2021/01-2024/12。
3.主持国家自然科学基金面上项目，31770838，2018/01-2021/12。
4.主持国家自然科学基金青年基金项目，31500664，2016/01-2018/12。
5.主持江苏省自然科学基金面上项目，BK20221443，2022/07-2025/12。
6.主持江苏省自然科学基金面上项目，BK20171338，2017/07-2020/06。
7.参与国家自然科学基金重点项目，31530046，2016/01-2020/12。
8.主持与南京诺唯赞生物科技有限公司技术开发横向合作项目，“基于二代测序和蛋白质组学的基因工程抗体开发”，2018/01-2020/12。
9.主持与南京集思慧远生物科技有限公司技术开发横向合作项目两项，“邻近标记-定量蛋白质组学和化合物小分子靶点蛋白鉴定技术开发”，2022/11-2025/10；“农林业定量蛋白质组学技术开发”，2021/01-2022/12。
10.主持南京大学中央高校基本费教育部创新团队项目、“双一流”科技专项、技术创新基金重点项目、原创与交叉项目、国际合作交流项目和人才引进启动基金项目等10余项。