方 雷

文章来源:南京大学医学院发布时间:2017-11-10浏览次数:1449



名:方雷


研究方向:疾病蛋白质组学/代谢与疾病发生


联系方式

电话:025-83596845

Email: njfanglei@nju.edu.cn


学术兼职:江苏省细胞与发育生物学学会理事,

中国细胞生物学学会会员


个人简介


  1. 工作简历:

2006年于南京大学生化系获得博士学位,之后于 20073-20119月在美国加州大学Irvine分校从事博士后研究,主要研究方向是生物质谱和蛋白质组学。201110-20152月担任美国纽约大学Langone医学中心助理研究员,主要研究方向是组蛋白修饰和表观遗传学。20153月开始担任南京大学医学院副教授、硕士生导师,主要研究方向是疾病蛋白组学


2.科研情况简介:

主要从事基于质谱蛋白质组学的代谢疾病和精准医学研究。主持国家自然科学基金青年项目/面上项目、江苏省自然科学基金面上项目和南京大学中央高校基本费国际合作促进项目多项,参与国家自然科学基金重点项目一项。目前共发表SCI论文20余篇,分别发表于蛋白质组学领域顶尖杂志Molecular & Cellular ProteomicJournal of Proteome Research以及Journal of Biological Chemistry。作为主要完成人参与了“微生物基因工程可溶性表达及产物后加工新技术”项目,并通过该研究获得了2011年江苏省科技进步一等奖(排名第三)2012年国家技术发明二等奖(排名第四);另外,该项目还于2013年获得第十五届中国国际工业博览会银奖。


3.研究兴趣:

1)代谢和药物小分子靶点蛋白的筛选和作用机制研究;(2)具有临床诊断和治疗价值的疾病蛋白标记物的筛选和鉴定;(3)复杂蛋白质复合物及其动态结合蛋白网络的高效亲和纯化和鉴定(AP-MSQTAX技术);(4)蛋白质翻译后修饰(磷酸化,乙酰化,泛素化和异戊二烯化修饰等)的鉴定和功能研究。


代表性论文

(1) Fang LChen DYu CLi HBrocato JHuang LJin C.Mechanisms Underlying Acrolein-mediated Inhibition of Chromatin Assembly. Mol Cell Biol. 2016 Nov 14; 36(23):2995-3008

(2) Brocato J (#)Fang L(#)Chervona YChen DKiok KSun HTseng HCXu DShamy MJin CCosta M.Arsenic induces polyadenylation of canonical histone mRNA by downregulating stem-loop binding protein gene expression.J. Biol. Chem.201428946):31751-31764

# co-first author.

(3) Chen D(#)Fang L (#)Li HTang MSJin C.Cigarette smoke component acrolein modulates chromatin assembly by inhibiting histone acetylation.J Biol Chem.201328830):21678-21687# co-first author.

(4) Fang, LeiKaake, Robyn MPatel, Vishal RYang, YingyingBaldi,PierreHuang, LanMapping the protein interaction network of the human COP9 signalosome complex using a label-free QTAX strategy.Molecular & Cellular Proteomics2012115):138-147

(5) Fang LWang XYamoah KChen PLPan ZQHuang L.Characterization of the human COP9 signalosome complex using affinity purification and mass spectrometry.J Proteome Res.2008711):4914-4925

(6) Fang LWuptra KChen DLi HHuang SKJin CYokoyama KK.Environmental stress-induced Chromatin Regulation and its Heritability.J Carcinog Mutagen201451):156-162

(7) Fang, LeiJia, Kun-ZhiTang, Ya-LanMa, Ding-YuanYu, MeiHua, Zi-ChunAn improved strategy for high-level production of TEV protease in Escherichia coli and its purification and characterization.Protein Expr Purif2007511):102-109

(8) Fang, LeiSun, Qi-MingHua, Zi-ChunExpression of recombinant chinese bovine enterokinase catalytic subunit in P. pastoris and its purification and characterization.Acta Biochim Biophys Sin2004367):513-517

(9) Chen D, Fang L, Mei S, Li H, Xu X, Des Marais TL, Lu K, Liu XS, Jin C. Regulation of Chromatin Assembly and Cell Transformation by Formaldehyde Exposure in Human Cells., Environ Health Perspect.2017 Sep 21;125(9):097019.

(10) Li QLi YGu BFang LZhou PBao SHuang LDai X.Akt Phosphorylates Wnt Coactivator and Chromatin Effector Pygo2 at Serine 48 to Antagonize Its Ubiquitin/Proteasome-Mediated Degradation.J Biol Chem.201529035):21553-67

(11) Yu CYang YWang X,Guan SFang LLiu FWalters KJKaiser PHuang L.Characterization of Dynamic UbR-Proteasome Subcomplexes by In vivo Cross-linking (X) Assisted Bimolecular Tandem Affinity Purification (XBAP) and Label-free Quantitation. Mol Cell Proteomics. 2016 Jul 15 (7):2279-92.

(12) Wu, KennethYan, HuaFang, LeiWang, XinjiangPfleger, CathieJiang, XuejunHuang, LanPan, Zhen-QiangMono-ubiquitination drives nuclear export of the human DCN1-like protein hDCNL1.J Biol Chem.201128639):34060-34070



承担科研项目

1.国家自然科学基金面上项目,31770838,“GGPP结合FBP1调控糖脂代谢参与肝细胞癌发生发展的机制研究”,2018/01-2022/12,在研,主持。

2.国家自然科学基金青年基金项目,31500664,“利用质谱表征TNF-α诱导的COP9信号小体作用蛋白网络变化”,2016/01-2018/12,在研,主持。

3.江苏省自然科学基金面上项目,BK20171338,“GGPP结合CPT1alpha调控肝脏脂质代谢的机制研究”,2018/01-2022/12,在研,主持。

4.国家自然科学基金重点项目,31530046,“蛋白质异戊二烯化调控初级卵泡/次级卵泡转换的作用和机制研究”,2016/01-2020/12,在研,参与。

5.南京大学中央高校基本费多项:包括国际合作促进项目两项、教育部“创新团队发展计划”团队青年研究人员项目一项以及南京大学人才引进启动经费等。