杨敬平

文章来源:南京大学医学院发布时间:2017-07-03浏览次数:2

杨敬平

研究方向:
1. 表观遗传学
2. 生物信息学
联系方式:email: jpyang@nju.edu.cn

个人简介
1.工作简历
    2000-2007于南京大学生物科学系学习,获本科、硕士学位。2007-2012于美国Emory大学生物和生物医学系学习,获博士学位。2012-2014于美国Emory大学进行博士后工作。2014年入选南京大学登峰人才,2014年至今任南京大学医学院副教授,硕士生导师。
2. 科研简介
    本课题组主要集中在表观遗传调控和多组学高通量数据整合。
    研究方向一,搭建染色体一维到三维的表观遗传特征捕获技术平台。在此平台上绘制细胞或组织特异性的表观遗传学图谱,解析基因组功能输出调控机制。
    研究方向二,利用生物信息学,整合包括基因组、转录组、表观组等多维高通量数据,阐述复杂疾病发生发展的基因组背景及其与环境的交互作用。
目前在研工作包括:
    绘制细胞/组织特异性的表观遗传学图谱,包括肾脏细胞的表观遗传图谱构建。
    药物表观遗传组的研究,包括药物在相关细胞内对转录因子结合图谱的作用机制。
    环境污染物对人或鼠基因组,如生殖细胞基因组的表观遗传学作用。

 代表性论文:

1. Yang J, Donlin-Asp PG, Corces VG. (2013) A specific subset of Drosophila Myc sites remains associated with mitotic chromosomes co-localized with insulator proteins. Nature Communications 4:1464

2. Yang J, Ramos E, Corces VG. (2012) The BEAF-32 insulator coordinates genome organization and function during the evolution of Drosophila species. Genome Res. 22(11):2199-207

3. Yang J, Corces VG. (2012) Insulators, long-range interactions, and genome function. Curr Opin Genet Dev. 22(2):86-92

4. Yang J, Corces VG. (2012) Chromatin Insulators and Epigenetic Inheritance in Health and Disease. Toxicology and Epigenetics Chapter 27

5. Yang J, Corces VG. (2011) Chromatin insulators: a role in nuclear organization and gene expression. Adv Cancer Res. 110:43-76

6. Timmerman C, Suppiah S, Gurudatta BV, Yang J, Banerjee C, Sandstrom DJ, Corces VG, Sanyal S. (2013) The Drosophila Transcription Factor Adf-1 (nalyot) Regulates Dendrite Growth by Controlling FasII and Staufen Expression Downstream of CaMKII and Neural Activity. J Neurosci. 33(29):11916-31

7. Gurudatta BV, Yang J, Van Bortle K, Donlin-Asp PG, Corces VG. (2013) Dynamic changes in the genomic localization of DNA replication-related element binding factor during the cell cycle. Cell Cycle 12(10): 1605-15

8. Van Bortle K, Ramos E, Takenaka N, Yang J, Wahi J, Corces V. (2012) Drosophila CTCF tandemly aligns with other insulator proteins at the borders of H3K27me3 domains. Genome Res. 22(11):2176-87

承担科研项目:
1.糖皮质激素受体在足细胞保护修复中的表观遗传学研究
国家自然科学基81500515,2016-2018,项目负责人
2.疾病相关SNP的表观遗传学解析
江苏省双创(创新类),2016,项目负责人
3.糖皮质激素受体转录调控机制研究
江苏省自然科学基金BK20150591,2015-2017,项目负责人
4.留学人员科技活动项目择优,2015,项目负责人
5.南京大学登峰人才计划 ,2014,项目负责人